De Kathedraal van de Maagd Maria, ook bekend als Panagia Trimartiri, wordt beschouwd als de beschermer van de stad Chania. De centrale gang is gewijd aan de Maagd Maria, de noordelijke zijbeuk aan Sinterklaas en de zuidelijke zijbeuk aan de Drie Cappadocische Vaders.
De kerk is gebouwd op de plek van een eerdere kerk, die hier naar verluidt al sinds de 14e eeuw stond. Later, bij de verovering van de stad door de Ottomanen in 1645, werd de kerk omgebouwd tot zeepfabriek, maar er werden geen wijzigingen aangebracht aan de buitenkant en de indeling van het gebouw. Vanaf dat moment is de geschiedenis verweven met lokale legendes. Nadat de zeepfabriek failliet was gegaan, schonk Mustafa Pasja, die in die tijd de eerste minister was, het gebouw aan de christelijke gemeenschap van de stad en vroeg om de wederopbouw van de tempel.
Volgens de legende nam Mustafa Pasja dit besluit toen zijn kind in een put in de buurt viel en werd gered met de hulp van de Maagd Maria. Ondanks de spanningen tussen de moslims en christelijke gemeenschappen, verliep de restauratie van de kerk zonder problemen. De renovatie werd voltooid in 1860 en resulteerde in het gebouw dat we vandaag de dag zien, een drieschepige basiliek met een verhoogde middenbeuk en talrijke architectonische elementen van Venetiaanse invloed, zoals gebeeldhouwde vierkante zuilen en kroonlijsten. Pas toen werd de icoon van de Maagd Maria, die door de laatste arbeider van de zeepfabriek was meegenomen, teruggebracht naar zijn rechtmatige plaats in de kerk. De geschiedenis van de kerk van Panagia Trimartiri kerk is verweven met de geschiedenis van de stad zelf. Het werd vaak gebruikt als toevluchtsoord en liep grote schade op tijdens de Kretenzische opstand van 1897. De renovatie werd uitgevoerd door de Tsaar van Rusland en de klokkentoren werd ook gebouwd dankzij zijn donatie. Trimartiri leed ook veel schade tijdens het bombardement op Chania in mei 1941.












